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一种检测非洲猪瘟病毒(ASFV)的新型灵敏等温扩增技术的建立

时间:2023-02-20   访问量:1029


01 一种检测非洲猪瘟病毒(ASFV)的新型灵敏等温扩增技术的建立


A Arun Prince Milton,Samir Das,Sabia Khan,K M Momin,C B Prasad,H Kylla,Sandeep Ghatak,Arnab Sen
PMID:36740635   DOI:10.1007/s00705-023-05702-z


为在田间或资源受限情况下对临床样本开展检测,本研究建立了一种快速、简便、灵敏的非洲猪瘟病毒(ASFV)核酸检测技术。基于世界动物卫生组织(WOAH)推荐的p72基因引物,首次采用跨越式滚环等温扩增(SRCA)技术检测ASFV。检测可在58°C等温条件下于90 min完成,不需复杂仪器。因SYBR Green荧光染料的存在,可用肉眼判定结果。该技术特异性为100%,仅能扩增ASFV阳性样本,而与猪的其他致病性病毒和细菌无交叉反应。SRCA、终点PCR和实时荧光PCR的检测下限分别为48.4、4.84×103和4.84×103 copies/µL。因此,新建立的SRCA技术比终点PCR和实时荧光PCR灵敏100倍。采用SRCA技术对2020—2022年期间从感染ASFV的家猪和其他疑似ASFV感染动物采集的临床样本进行检测,结果发现准确率为100%。结果表明,SRCA是检测ASFV的一种简单、敏感技术,可提高实验室现场诊断能力,尤其是在疫情暴发期间。由于成本低、特异性强、敏感性好、用户友好、快速可靠、无需设备等优点,这种新型诊断技术完全符合世界卫生组织(WHO)倡导的疾病诊断“ASSURED”标准。因此,SRCA可能比其他复杂分子技术更适合ASFV诊断。
原文链接:‍https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740635/

02 分离自印度的牛结节性皮肤病 病毒(LSDV)具有独特谱系


Lenin Bhatt,Rahul C Bhoyar,Bani Jolly,Ravi Israni,Harie Vignesh,Vinod Scaria,Sridhar Sivasubbu
PMID:36740645    DOI:10.1007/s00705-023-05705-w
牛结节性皮肤病病毒(LSDV)以前仅限于在非洲地区传播,然而近年来,其已在全世界几个区域引起了规模疫情。2019年印度报告了一起LSD疫情,此次疫情发病率低,未报告死亡病例。2022年印度7个邦持续暴发LSDV疫情,最终导致3个月内损失8万多头牛。在印度拉贾斯坦邦疫情持续暴发期间,从感染牛分离了6株LSDV,并对其完整基因组序列进行了分析。结果表明,与参考株相比,2022年疫情分离毒株基因组具有大幅遗传变异,并且形成了独特的遗传谱系。因此,应加强基因组测序和跨界疫病病原体监测,以跟踪变异病原的出现和流行。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740645/

03 一起养殖鸭不明原因死亡疫情中禽肝病毒和圆环病毒的鉴定


Dianqi Zhang,Yan Wang,Yumin He,Likai Ji,Kai Zhao,Shixing Yang,Wen Zhang
PMID:36763177   DOI:10.1007/s00705-023-05719-4

病毒宏基因组学技术可应用于疫病病原体研究。使用该技术,我们查明了导致鸭场大量鸭死亡的潜在病原体。经检测,共鉴定出2株鸭圆环病毒(DuCV)和1株鸭乙型肝炎病毒(DHBV),二者均与禽类病毒密切相关。2株DuCV与部分参考毒株全基因序列同源性为81.64%~97.65%,DHBV分离株与其他毒株同源性为75.85%~98.92%。病鸭临床症状包括羽毛皱褶、嗜睡和体重减轻,这与DuCV感染病例类似。DuCV与DHBV合并感染是否导致肝损伤和疾病恶化,还需进一步研究。
原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36763177/










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